飞快地给勋贵定罪之后，朱皇帝就继续了对其余中枢部门的整肃。
对兵部的整肃，和改制基本上是同步进行的。
只是把兵部稍微一查，就让朝堂上的重臣们脸上火辣辣地疼。
武官的人事和功赏等事，被武选和职方两清吏司折腾得可以说是一团糟。没有关系、不送钱的武将，可以说根本就没法在军中立足，没有大佬罩着，又不肯送钱，就算你立功了，想升官这辈子都是不可能的。
武库清吏司管着的仓库，武器都是破烂，各种账目稍微一查就能找出一堆的漏洞。
车驾司勾结太仆寺，在军马上做假账，以次充好，他们管理的驿站更是稀烂，大量关系户被送进去当驿丞。
对兵部的初步清洗开始后不久，朱皇帝就把朝堂上的重臣们都召集了在一起，然后把一堆的案件卷宗丢到了他们面前。
“你等都瞧瞧，我大明满朝上下，有几人不贪，不受贿？户部、兵部之中，有几人干净？如今朕还只是查到了户部与兵部头上。接下来，又要查出多少贪官污吏？中枢如此，地方上是何种模样还用多想？”
说着，他环视了一圈。
此时，内阁、九卿和六科等重要官员，早就全部跪下。
“以朕看，我大明如今便到了末世。要不了多久，各处百姓便不堪忍受，会纷纷揭竿而起。若朕再放纵贪腐，天下大乱之后，就必有英雄出，兴仁义之师，吊民伐罪，让朕与诸位中的多数人，都死无葬身之地！”
这话可以说重极了，吊民伐罪都说出来了，完全是把眼下的大明朝廷彻底定性成了残虐百姓的反派。
“陛下为此言，臣死罪。”
一众大臣们，这会才算是明白皇帝为何这么激进。
皇帝原是觉得大明烂透了，再不整治，这大明就药丸。
他们虽说不完全认同这一点，但最近的诸多大案，又让他们不好反驳。他们当然清楚大明很烂，但是完全没想到，大明已经烂到了这个地步。
“你等回去把朕的话，都好好想想。告诉你等在地方上的亲友，他们要造反，就趁早跳出来。朕不怕。”
一众大臣们，只得唯唯诺诺地退下。
随着大批官吏入狱，兵部下属的职方清吏司被彻底废除，武选清吏司的职权也被直接砍了一刀，武库清吏司也被并入了后勤清吏司，车驾清吏司暂时保留。
太仆寺既然都被查出来有问题，朱皇帝自然不会放弃，很快整个太仆寺衙门上下的官吏就无一例外地落马。
太仆寺全体官员都落马之后，朱皇帝就召集几位重臣，开始讨论马政和太仆寺的问题。
一开始，朱皇帝就问道：“国朝设太仆寺，所为者无非军马，如今太仆寺为何变为了钱粮衙门？”
李起元站出来说道：“太仆寺马原本专给团营骑操，自从官养马场废弛之后，就改成把官马分派给民户饲养，过一定时期征收约定马匹之政，这便是所谓的俵马法。由于官吏易于借征马盘剥马户，不能得马，不久也废弛。
之后，太仆寺征收也逐渐变为折色，牧马草场也多租给百姓收租，种马变卖后向百姓收草料银。
自从行太仆寺废，西北苑马寺废后，除辽东少求于中枢外，各边军之马也皆仰给于太仆寺。边军和京营上报缺额，由兵部会同科道官审核，太仆寺发银，在科道监督下购买马匹。”
朱皇帝闻言点了点头，说道：“朕记得没错的话，这马户上交的折色银，原来应该就是民户免去的国税徭役是吗？”
汪应蛟出列点头说道：“当日太祖以为，马政乃国之重者，古人先马而后钱粮，故数马以对。为使得百姓能专注养马，故豁免了马户的正税和各项差役。”
朱皇帝又问道：“汪爱卿，据朕所知，这马户每岁征草料银一两，每三年征收马匹一匹，折色20两。也就是说，每户每岁要征收数两银子。这比平常民户的赋役起码高出了一倍不止。这难道不是恶政？朕以为，当废除马户，将其编入民户。”
汪应蛟闻言脸上立刻浮现出了喜色，太仆寺这征收太狠，也不是第一次有人反映，不过看在每年收的大几十万两的银子的份上，皇帝根本不会去理会，现在这些马户总算是不用再被朝廷盘剥了。
“陛下圣明。”
朱皇帝接着说道：“太仆寺既无马，也养不得马，继续存在，也是多一些冗官，不如就此废除。其名下牧马草场，暂且归为官田，之后便逐渐发卖于百姓。”
反正，太仆寺在中枢的人员，都被皇帝一锅端了，再多说也没什么意思。皇帝的态度十分坚决，冗官这话都说出来了，这些文官们，也不敢拿祖制和马政不可废这类站不住脚的理由反对。
内地基本上早就没有人养马了，太仆寺的草场如今都是什么用途，在座的自然都是一清二楚。变为官田后发卖，不少官员是有点意见的，不过皇帝明显就是打算把全国的官田都废了，改革的态度比张居正坚决多了，明显是清楚官田这玩意稍有放松监管就会变成什么鬼样子，他们当然不敢站出来反对，官田的利益是让很多官员不愿意放手，得罪那帮人在以往后果很严重，然而到了如今这份田地上，那帮人都不知能有几个保住官身。
太仆寺现在职能也是和户部重合，朱皇帝早就琢磨着要把这个衙门直接撤销。
他当然不会在内地养马，因为那根本就是和人争食，在即将到来的大旱灾下，那根本是杀人。没有马，暂时可以直接去蒙古买，之后把蒙古彻底消化，大明自然有的是土地养马。
辽东的苑马寺在辽沈失陷后，就自动废除。至此，大明所有官方的马政管理机构，就全部被废除。之后，朱皇帝也不会继续搞什么封建官管马政，这事也就是汉代稍微搞得好点，其他王朝都是把马政管得一团糟。
军马的问题，朱皇帝倒是不大担忧，日后消化掉了蒙古，大明就不会再缺军马。他现在发展的，主要都是民间也用得着的拉货和耕地用的挽马。
他准备发展几个专业的国营马场，保证内部竞争的同时，也起到一个带头作用，带动私营马场的发展，在他的规划中，未来大明用马还是以私营马场为主。
现在，御马监就正在用皇帝指导的技术资料，进行艰苦而漫长杂交工作。
御马监的任务，目前主要是三种马儿，一种是用中亚等地区的马种和蒙古马进行杂交而培育的战马，一种则是适应华北地区气候的重型挽马，一种是适应东北地区气候的挽马。
从现在开始，这项工作要彻底完成，差不多还要二十年。
在他不时地敲打和赏赐下，御马监的纪用，没有大肆贪污，更不敢弄虚作假，只是育种就需要那么久。
对此，朱皇帝也不急，大明这会也不可能在内地大力养马去和人争食。私营养马业，要真正发展起来，自然还是得先把辽东和蒙古都彻底消化掉。
而要真正消化掉北部大片地广人稀的土地，自然还是得要把帝国内部的问题解决。
这一次，对兵部的整肃，车驾司管的驿站问题也再一次完全暴露了出来。
驿站这个问题，朱皇帝当然十分清楚。
那位下岗的驿卒李自成的故事，后世不知道的人可不多。
另外，他不止知道李自成，还清楚，大明靠着关系，滥用驿站的人里头，这会有位在后世会挺出名，他的名字叫徐弘祖，字振之，号霞客。
这位徐霞客，虽说是书香门第出生，不过他爹都不愿意做官，他也连个功名都没有，自然也算不得什么名门望族，然而他依旧凭借祖辈和自己经营的关系，轻易地免费使用了全国的驿站，完成了全国旅行这种这时代几乎没人能完成的伟业。
徐霞客个人的经历，也无疑说明了大明对驿站的管理有多稀烂。
为此，朱皇帝还专门把徐霞客请到了京师，直接资助了他一笔银子，给他配了个保镖，让他花皇帝的钱去考察国家地理，把长江等水系的源头问题考察清楚。
就驿站问题，朱皇帝很快开了个专门的会议。
左都御史孙玮首先就开炮了，他直接说道：“当初张居正为相时，最严乘传。当时每马一匹，草料仅二十八金，每夫一名，工食银仅七两二钱。
时至今日，法纪荡尽，巧伪滋彰，兵部之勘合火牌有发出无缴进，缙绅竞相假借，奸棍互相买卖，一纸洗补数番，一人往返数用，而一省之中两院有牌，司道府有票，乡官有帖，应付不一。
今日每马草料银加至百余金，每夫一名加至三五十金。民生安得不蹙，国计安得不穷。还请陛下禁革诸弊。”
朱皇帝点了点头，说道：“孙爱卿所言极是，据朕所知，大明的驿站，目前为止，八成左右都是私用，真正的公务来往，不过两成，官员因公使用驿站，一样有排场巨大，花销极大的问题。全国驿站开销，一岁大致在三百万两有奇，数额之大，让朕颇为忧心。诸卿可有良策？”
李起元很快站出来说道：“陛下，驿站问题，并非今日方才暴露。国朝多位贤臣都有整治，只是都只有一时的效果。以臣之见，导致驿站问题难以根治，正是大明上下风气败坏。唯有重典治吏，讲求道德，使得风气一新，方才能杜绝驿站私用。”
一开始，朱皇帝曾经准备对驿站大规模动刀，试着推出邮政公司，不过很快他就放弃了这种不切实际的想法。
正如李起元说的，大明对驿站又不是没有监管制度，也不是没有人整治，只是整个社会的风气败坏之后，再好的制度，在人们都将法纪视为无物时，它也没有半点用处。
李起元的说法，很快得到了一众大臣的赞同，也纷纷提出了一些改进意见。
朱皇帝也没打算彻底禁止私用，在他看来，私用不是问题，付钱就是。
“大明驿站会通天下，仅仅用于军情和朝廷政务的传递，朕以为却是不妥。
白牌、勘合火牌之滥发，归根结底，还是民间有所需。朕以为，并非所有的人盗用白牌、勘合，都是想要侵占朝廷的利益，主要还是因为方便，朝廷又不许私用。
朕以为，在保证军务和朝廷公文的往来之余，不妨把驿站开放给商民付费使用，住宿收取银两。如此便能减轻地方州县的负担，也不至于让一些确系急用驿站的商民犯禁。”
皇帝这么一说，大臣们立刻就感到有些头疼。
这个想法，并不是没有人想到，不过官僚们从来都是多一事不如少一事，皇帝这么搞，很明显会增加许多新问题，大大增加了管理难度。
李起元立刻就站出来说道：“陛下，这驿站若可私用，收取费用又不免滋弊。”
“容易滋弊，便要商民露宿野外，将驿站空置，岂不是浪费？做事何必因噎废食？此议可行与否，还是得先试行。”
朱皇帝本来是打算推行所有人一律付费，公务的搞报销，不过在大明的中央和地方财政的许多问题没有解决前，这显然是不现实的，这个计划要实行，也一样有很多的细节需要去完善。
当然，他更清楚，自己现在能完全控制的地方，也只有北直隶和辽东而已。经过他这么一闹，中枢的许多政令，现在到了地方上都成了废纸。
皇帝坚持这么干，这个事自然也就彻底定了下来。
在清洗北直隶的胥吏的同时，对驿站的整肃也会同步进行，腾出一大堆的驿丞位置后，他也会把一些实在不愿意分田，又不愿意去其他地方的武官安置到驿站里去。
有些武官，没本事从军，然而就是死活不肯放弃那个官身，这些人都穷困潦倒，也没犯什么错误，他实在不好处理。
